Espressione dei geni dalla superficie della pelle

introduzione

Attualmente, molte diagnosi cliniche in dermatologia dipende da istopatologico conferma, che è soggettiva e richiede un intervento chirurgico biopsia.

Gene L'analisi dell'espressione è più oggettiva e dovrebbe migliorare la gestione del tumore e infiammatorio Malattia della pelle.

Molecolare tecniche di analisi

Le tecniche di analisi molecolare attualmente dipendono dal tessuto ottenuto dalla chirurgia biopsie. Loro includono:

• Fluorescenza nel posto ibridazionePESCE)
• Ibridazione genomica comparativa (CGH)
• Corriere di consegna acido ribonucleico (MRNA) profili di espressione.

Questi test possono aiutare a prevedere il comportamento di melanocitico neoplasieCompreso melanoma.

Pelatura del nastro

Il nastro adesivo può essere utilizzato per rimuovere epidermico cellule sulla superficie della pelle.

• Acido ribonucleico (RNA) può essere recuperato dalle celle attaccate al nastro.
• L'RNA può essere quantificato mediante trascrittasi inversa.Reazione a catena della polimerasi (RT–PCR) e delineato da DNA microarray.
• L'RNA recuperato dall'estrazione del nastro può trasmettere accuratamente in tempo reale fisiologia e derivare profili di espressione differenziale.

L'intero umano genoma è stato esaminato per la diversa espressione genica tra melanoma e altri pigmentato pelle lesioni. I livelli di espressione dei 30.000 esseri umani geni sono stati misurati in melanomi e lesioni non melanomatiche campionando la pelle con cerotti adesivi. Utilizzando un'analisi statistica avanzata dell'apprendimento automatico, è stato trovato un set di sei geni i cui livelli di RNA potevano differenziare in modo affidabile tra melanoma e altre lesioni pigmentate.

Il gen PRAME (preferibilmente espresso antigene nel melanoma) ha un ruolo nell'oncogenesi (formazione di tumori), mentre il gene LINC00518 (lungo intergenico nproteina che codifica per RNA 518) è un membro di una classe di RNA regolatrice recentemente descritta molecole; entrambi i geni sono elevati nei melanomi rispetto alle altre lesioni. Gli altri quattro geni forniscono valori normali per i processi di laboratorio.

Basato sui profili di espressione di LINC00518 e PRAME in campioni di tessuto cutaneo ottenuti mediante adesivo patch biopsie, un pigmentato lesione è stato sviluppato il test (PLA) (DermTech, Inc., California, USA). Un ampio studio di convalida che ha coinvolto 555 pazienti ha stabilito che il PLA può classificare accuratamente le lesioni cutanee pigmentate con una sensibilità di 92% e una specificità di 69%. Dopo aver incorporato l'uso del PLA, dermatologi migliorato il suo metà sensibilità della biopsia da 95.0% a 98.6% (p = 0.01) nel sospetto melanoma, mentre la specificità è aumentata da 32.1% a 56.9% (p <0,001).

Saggi di espressione genica

Sono in fase di sviluppo test di espressione genica per l'identificazione citochina Profili infiammatori di campioni raccolti con cerotti adesivi.

• Citochine vengono lanciati da autoimmune risposte in malattie infiammatorie come la psoriasi, atopica dermatitee cutaneo lupus eritematoso.
• I farmaci biologici usati per trattare le malattie infiammatorie prendono di mira citochine specifiche.
• I cambiamenti nell'espressione genica possono identificare i pazienti con uno specifico profilo di citochine che possono rispondere a un particolare tipo di terapia farmacologica.
• L'espressione genica può essere utilizzata per monitorare la risposta alla terapia e potenzialmente prevedere riacutizzazioni nei pazienti.

Altri usi dei saggi di espressione genica

Una domanda TNF"È stato proposto un prodotto che aiuterebbe a monitorare i pazienti in terapia biologica per la psoriasi e determinare quando è necessario un cambiamento nella terapia.

Un prodotto "Cytokine Ex 17" che misura i cambiamenti nell'espressione genica di interleuchina (IL) -17 percorso, che include TNF-alfa e IL-23 e potrebbe essere usato come biomarcatore per studi clinici e per valutare lo stato delle citochine della pelle di un paziente.

Sono in corso anche studi clinici per convalidare un test di espressione genica da rilevare squamoso cellula carcinoma e basale Carcinoma cellulare utilizzando campioni di pelle raccolti con un kit per biopsia cutanea con cerotto adesivo.

Altre applicazioni della tecnologia sono in corso sviluppo.

Sommario

L'espressione genica differenziale può essere rilevata rimuovendo il nastro dalla superficie della pelle per aiutare nella diagnosi di melanoma, pelle non melanoma Cancro e malattie infiammatorie della pelle.