Expresión de genes de la superficie de la piel

Introducción

En la actualidad, muchos diagnósticos clínicos en dermatología depende de la histopatológico confirmación, que es subjetiva y requiere cirugía biopsia.

Gene El análisis de expresión es más objetivo y se espera que mejore el manejo de tumores y inflamatorio dermatosis.

Molecular técnicas de análisis

Las técnicas de análisis molecular actualmente dependen del tejido obtenido de cirugía biopsias. Incluyen:

• Fluorescencia en el lugar hibridaciónPESCADO)
• Hibridación genómica comparativa (CGH)
• Mensajero ácido ribonucleico (ARNm) perfiles de expresión.

Estas pruebas pueden ayudar a predecir el comportamiento de melanocítico neoplasias, incluyendo melanoma.

Pelado de cinta

Se puede usar cinta adhesiva para quitar epidérmico células de la superficie de la piel.

• Ácido ribonucleico (ARN) se pueden recuperar de las células adheridas a la cinta.
• El ARN se puede cuantificar mediante transcriptasa inversa.reacción en cadena de la polimerasa (RT–PCR) y perfilado por ADN microarrays.
• El ARN recuperado por extracción de cinta puede transmitir con precisión en tiempo real fisiología y derivar perfiles de expresión diferencial.

El humano entero genoma se ha examinado para determinar la expresión génica diferente entre el melanoma y otros pigmentado piel lesiones. Los niveles de expresión de los 30.000 humanos genes fueron medidos en melanomas y lesiones no melanomas tomando muestras de la piel con parches adhesivos. Utilizando análisis estadísticos avanzados de aprendizaje automático, se encontró un conjunto de seis genes cuyos niveles de ARN podían diferenciar de manera confiable entre el melanoma y otras lesiones pigmentadas.

El gen PRAME (expresado preferentemente antígeno en el melanoma) tiene un papel en la oncogénesis (la formación de tumores), mientras que el gen LINC00518 (largo intergénico noproteína codificante de ARN 518) es miembro de una clase recientemente descrita de ARN regulador moléculas; ambos genes están elevados en los melanomas en comparación con las otras lesiones. Los otros cuatro genes proporcionan valores normales para los procesos de laboratorio.

Basado en perfiles de expresión de LINC00518 y PRAME en muestras de tejido cutáneo obtenidas mediante adhesivo parche biopsias, un pigmentado lesión se desarrolló el ensayo (PLA) (DermTech, Inc., California, EE. UU.). Un gran estudio de validación que incluyó a 555 pacientes estableció que el PLA puede clasificar con precisión las lesiones cutáneas pigmentadas con una sensibilidad del 92% y una especificidad del 69%. Después de incorporar el uso del PLA, dermatologos mejorado su media sensibilidad de la biopsia del 95,0% al 98,6% (p = 0,01) en la sospecha de melanoma, mientras que la especificidad aumentó del 32,1% al 56,9% (p <0,001).

Ensayos de expresión génica

Se están desarrollando ensayos de expresión génica para identificar citocina Perfiles inflamatorios de muestras recolectadas con parches adhesivos.

• Citocinas son lanzados por autoinmune respuestas en enfermedades inflamatorias como la psoriasis, atópico dermatitisy cutáneo lupus eritematoso.
• Los fármacos biológicos utilizados para tratar enfermedades inflamatorias se dirigen a citocinas específicas.
• Los cambios en la expresión génica pueden identificar a los pacientes con un perfil de citocinas específico que puede responder a un tipo particular de terapia con medicamentos.
• La expresión génica se puede utilizar para controlar la respuesta a la terapia y predecir potencialmente los brotes en los pacientes.

Otros usos de los ensayos de expresión génica

Una respuesta TNF”Se ha propuesto un producto que ayudaría a monitorear a los pacientes en terapia biológica para la psoriasis y determinar cuándo es necesario un cambio en la terapia.

Un producto «Cytokine Ex 17» que mide los cambios en la expresión génica del interleucina (IL) -17 vía, que incluye TNF-alfa e IL-23, y podría utilizarse como biomarcador para ensayos clínicos y para evaluar el estado de citocinas de la piel de un paciente.

También se están realizando ensayos clínicos para validar una prueba de expresión génica para detectar escamoso célula carcinoma y basal carcinoma celular mediante el uso de muestras de piel recolectadas con un kit de biopsia de piel con parche adhesivo.

Más aplicaciones de la tecnología están bajo desarrollo.

Resumen

La expresión génica diferencial se puede detectar mediante la extracción de cinta de la superficie de la piel para ayudar en el diagnóstico de melanoma, piel no melanoma cáncer y enfermedad inflamatoria de la piel.